Τη σεζόν 2006-07 με προπονητή το Νίκο Φραγκεσκάκη, ο Γ.Σ. Διαγόρας κατέκτησε έναν ακόμη τίτλο στα Δωδεκάνησα και μάλιστα τα κατάφερε στα μπαράζ ανόδου, ανεβαίνοντας στον 2ο όμιλο νότου της Γ’ Εθνικής. Οι αγώνες μπαράζ διεξήχθησαν στο κλειστό γυμναστήριο της Εργάνης στο Βύρωνα και παρά την ήττα από τον Ίκαρο Ικαρίας, ο «γηραιός» κέρδισε τα άλλα τρία παιχνίδια (Αρίων Μυτιλήνης, Φ.Ο. Φροντάδου Χίου) Πανναξιακός) και πήρε το εισιτήριο. Ιδού η πρωταθλήτρια ομάδα Δωδεκανήσου τη σεζόν 2006-07. Διακρίνονται από αριστερά (όρθιοι): Νίκος Φραγκεσκάκης (προπονητής), Αντώνης Μαρκάκης, Μάκης Δούβαλης, Γιάννης Ξυπολιάς, Νίκος Ηλιού, Βησσαρίων Κούκιαλι, Γιώργος Τσιμέττας (έφορος) και καθιστοί οι: Δημήτρης Αθανασιάδης, Γιώργος Κούκιαλι, Παναγιώτης Σελλάς, Γιάννης Μαρουλλάκης, Μιχάλης Τσιγάρος και Μωυσής Σακκής. Στην ομάδα αγωνιζόταν και ο Παναγιώτης Φυλτζανίδης. Ο Γ.Σ. Διαγόρας κατέκτησε τον τίτλο στο κλειστό γυμναστήριο της Κω, έχοντας κερδίσει τον Ιπποκράτη στον πρώτο τελικό στην ''τέντα'' με 73-68 και τον δεύτερο εκτός έδρας με 81-77.
